Dříve by měla být zprůjezdněna trať z Raspenavy do Frýdlantu v Čechách, fungovat má od 10. září. Povodeň tam způsobila sesuvy půdy, některé úseky trati a náspy byly odplavené. Podobná situace nastala také na trati Frýdlant - Jindřichovice pod Smrkem, kde navíc byla zaplavená i řada přejezdů. Tam by se mělo začít jezdit 17. září.

V noci na střdu však začaly poprvé od povodní jezdit vlaky z Liberce do Chrastavy. Až do Hrádku nad Nisou však lidé dojedou až od 10. září. Výluka na této trati se totiž nyní přesunula na úsek Chrastava - Hrádek, který sice po povodni fungoval, ale trať byla opravena jen provizorně. V některých místech musely vlaky jezdit jen desetikilometrovou rychlostí. Před příchodem zimy je proto nutné trať upravit plnohodnotně. Cestující mohou využít náhradní autobusové dopravy.

Kromě těchto tří tratí zůstává v Libereckém kraji neprůjezdná ještě trať z Horní Police do Děčína.